Estructura genética de una población de bovinos Holstein en el departamento de Antioquia, usando polimorfismos del gen del factor de crecimiento insulínico tipo 2 (IGF2a)

Resumen

Desde los inicios de la tecnificación del campo, el objetivo de la producción pecuaria ha sido el perfeccionamiento de los sistemas por medio de la optimización de los recursos para alcanzar alto nivel productivo. No todos los componentes biológicos de dichos sistemas responden de igual manera a los nutrientes ofrecidos, esto en gran parte debido a su componente genético. Como respuesta a esta situación ha surgido una herramienta de gran utilidad que se podría implementar y aplicar al manejo diario de los sistemas de producción lechera del país. Esta herramienta es el mejoramiento genético por medio de la manipulación molecular o selección asistida por marcadores moleculares (MAS). El objetivo de esta investigación fue determinar la estructura genética de una población Holstein de Antioquia usando el polimorfismo 292 C>T del gen factor del crecimiento insulínico tipo 2 (IGF2a). Una población de 1054 animales de la raza Holstein, distribuidos en 6 subpoblaciones de Antioquia fue evaluada, la genotipificación se llevó a cabo utilizando la técnica PCR-RFLP. Para determinar los estadísticos F de Wright, el equilibrio de Hardy-Weinberg (HW) y las distancias de Nei se utilizaron los programas Genalex 6 y Arlequin 3.5. Las frecuencias alélicas para el polimorfismo 292 C>T de IGF2a fueron para T 0,405 y para C 0,595. La población total se encontró en equilibrio de Hardy-Weinberg, sin embargo, la subpoblación de El Retiro no mostró equilibrio HW. La estructura genética de la población mostró baja diferenciación entre todas las subpoblaciones estudiadas, donde el FST fue 0,002. El nivel de Fit fue de 0,263 y el de Fis de 0,261, ubicándose en los rangos bajos descritos por Wright.

Palabras clave:

estadísticos F de Wright

PCR-RFLP

SNPs

Wright’s F-statistics

PCR-RFLP

SNPs

Citas

 Echeverri, J.; Saldamando, C.; López, A. 2015. Genetic structure analysis of a Holstein cow population in Colombia. Rev Colom Cienc Pecua, v.28, n.1, p.54-63, 2015. Disponible en: Link Accesado en 10/02/2016

 Eguiarte, L.E.; Aguirre-Liguori, J.A.; Jardón-Barbolla, L et al. Genómica de poblaciones: nada en evolución va a tener sentido si no es a la luz de la genómica, y nada en genómica tendrá sentido si no es a la luz de la evolución. TIP. Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, v.16, n.1, p.42-56, 2013.

 Eguiarte, L.E.; Aguirre-Liguori, J.A.; Jardón-Barbolla, L. et al. Genómica de Poblaciones: Nada en evolución va a tener sentido si no es a la luz de la Genómica, y nada en Genómica tendrá sentido si no es a la luz de la evolución. TIP, v.16, n.1, p.42- 56, 2013. Disponible en: Link. Accesado en 24/02/2016

 Excoffier, L.; Laval, G. & Schneider, S. Arlequin (ver. 2.0): An integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics, v.1, p.47- 50, 2005.

 Goodall, J.J.; Schmutz, S.M. Linkage mapping of IGF2 on cattle chromosome 29. Animal Genetics, v.34, p.302-318, 2003.

 Goodall, J.J.; Schmutz, S.M. 2007: IGF2 gene characterization and association with rib eye area in beef cattle. Animal Genetics, v.38, p.154-161, 2007. Disponible en: Link Accesado en 24/02/2016

 Hartl D. 2000. A primer of population genetics. Connecticut: Sinauer Associates, 221p.

 Hitchins, M.P. & Moore, G.E. (2002). Genomic imprinting in fetal growth and development. Expert Reviews in Molecular Medicine, p.1-19. Disponible en: Link Accesado en 03/03/2016

 O’Dell, S.D.; Miller, G.J.; Cooper, J.A. et al. Apal polymorphism in insulin-like growth factor II (IGF2) gene and weight in middle-aged males. International Journal of Obesity, v.21, n.9, p.822-825, 1997. Disponible en: Link Accesado en 05/04/2016

 Ohlsen, S.M.; Lugenbeel, K.A. & Wong, E.A. Characterization of the linked ovine insulin and insulin-like growth factor-II genes. DNA and Cell Biology, v.13, n.4, p.377-388, 1994. Disponible en: Link Accesado en 05/04/2016

 Peakall, R. & Smouse, P. Genalex6: Genetic analysis in excel population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, v.6, p.288-295, 2006. Dispobible en : Link Accesado en 06/06/2016

 Rincón, J.; López-Herrera, A. & Echeverri, J. Estructura y diversidad genética en vacas Holstein de Antioquia usando un polimorfismo del gen bGH. Rev. MVZ Córdoba, v.18, n.1, p.3346-3354, 2013. Disponible en: Link Accesado en 06/06/2016

 Rodríguez, N.; López-Herrera, A. & Echeverri, J. Estructura genética poblacional del gen lactoferrina bovino en vacas Holstein del departamento de Antioquia. Rev. MVZ Córdoba, v.18, n.1, p.3355-3361, 2013. Disponible en: Link Accesado en 07/06/2016

 Sambrook, J.; Fritsch, E. & Maniatis, T. Molecular cloning: a laboratory manual. USA. En: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. 53-73.

 Wright, S. Evolution and the genetics of populations: experimental results and evolutionary deductions (Vol. 3). University of Chicago Press. 1989.

 Wright, S. Evolution and genetics of population, the theory of gene frequencies (2da. ed.). Chicago: University of Chicago Press, 1989.

 Zwierzchowski, L.; Siadkowska, E; Oprzadek, J. et al. An association of C/T polymorphism in exon 2 of the bovine insulin-like growth factor 2 gene with meat production traits in Polish Holstein-Friesian cattle. Czech Journal of Animal Science, v.55, n.6, p.227–233, 2010. Disponible en: Link Accesado en 05/07/2016